說起柱溫箱，對于常做液相分析的人肯定不陌生，幾乎是標配；柱溫箱可以使得色譜保留更穩定（不受溫度波動干擾，色譜重現性更好）；更好的色譜分離效率和更對稱的峰形（改善范第姆特方程的傳質項）。但對于做蛋白質組學的朋友來說，這個似乎并不常見，最主要的原因就是，這個產品很多實驗室基本上都是自制的，沒有廠家的標配產品。對于納流色譜來說，柱溫箱除了我們上面提到的好處外，還可以降低系統壓力；降低系統壓力可以使我們系統變得更加穩定，能夠使用更細的色譜柱和更細的填料，以獲得更好的分離度和系統靈敏度。
一般而言，色譜分析過程是靠流動相中的樣品和固定相的結合-分離差異達到分離物質
的作用，溫度可以影響結合-分離過程，從而影響色譜分析過程。改變柱溫對分離度和峰形是有影響的,但影響比較小，影響色譜柱分離度的因素是固定相的種類、性質（粒度、粒徑分布等）、填充狀況、柱長、流動相的種類和流速及測定柱效所用物質的性質等。具體如下：
（1）色譜長度和填料的性質，色譜柱越長，組分之間分辯效果越好，但色譜柱越長壓降越大，而輸入的壓力是有限的。色譜柱過長會增大進出口壓力比，相反會降低分離度；
（2）色譜柱填料顆粒大小也是主要因素，粒子越細，由于表面積增加，分辯效果越好，但是顆粒細會增大柱壓降，也會起反作用；
（3）柱溫對分辯效果也有很大影響，因為氣體在液體中的溶解度或在固體表面的吸附程度都隨溫度增高而降低，在氣液色譜分析中，當超過一定溫度時，靜態的液體通常會從色譜柱中揮發掉，所以選擇柱溫時應考慮到樣品的沸點。一般是略低于樣品沸點的平均值；
（4）載氣種類的影響。常用的載氣有 N2、H2、He、Ar 等，其中 H2、He 氣的分子量較小，有利于提高分析速度，但濃度較高的介質易在其間形成擴散，影響分離度，所以在實際測量中 H2、 He 氣體一般都用在介質濃度較低的區域并提高其流速，減少擴散的影響。N2、Ar 等分子量較大的氣體的優點是擴散作用小，缺點是在柱中壓降大流速慢，即分析周期長；
（5）載氣流速的影響。介質在固定相上的滯留時間，主要取決于介質自身的特性(揮發性，
極性等)和載氣的流速。所以流速快慢直接影響分離度；
（6）進樣時間和進樣量的影響。進樣時間應盡量短，原則上的瞬間進樣會提高分離度。進樣量應盡量小，但應使檢測器能夠識別。因此，提高色譜柱分離度可以通過增加柱長，減少進樣量，降低載氣流速，降低色譜柱溫度，提高汽化室溫度，減少系統的死體來實現。
不論使用液相色譜儀進行是何種分析，穩定高、靈敏度高以及重現性好這幾點要求都是必不可少，而如何更好的做到這一點，在我看來柱溫箱起到了關鍵的作用。
柱溫箱主要作用在于使柱子的溫度保持一定，按照溫度調節方式大致可分為三種，分別為：空氣循環式、浴液式（水夾套式）以及模塊加熱式。
這里就柱溫箱的任務作一些簡單的探討。
在液體色譜法中，支配在柱內之分離的方式有①分配，②吸附，③離子交換，④尺寸排除等。這些方式在于化學性的或者物理性的平衡狀態，也依存于溫度。因此，通過穩定地保持柱溫，可使平衡穩定化，在試樣的分離，選擇性，以及保留時間上得到良好的重現性。一般來說，由于與ODS 柱等分析方式的柱相比，離子交換柱更易于受到溫度影響，因此溫度調節更為重要。
另外，由于溫度趨高的其目的成分與固定相的平衡將變快，因此一般來說柱效率將增長，峰更明晰，分離呈改善的傾向。
隨著溫度的升高，液體的粘度將降低。因此，通過在高于室溫的溫度下進行分析，可以降低柱入口處的壓力，控制給柱帶來的負擔。尤其是在采用了耐壓性低的聚合物系填料時，更尤為重要。
示差檢測器、電化學檢測器、電導度檢測器等一些檢測器容易受到溫度變化的影響，一旦由于室溫變化使流動相溫度變化，則基線將偏移或彎曲，不能進行穩定的分析，通過使柱溫保持一定，也就是使流入檢測器內的移動相溫度保持一定，從而能夠有穩定的分析
如上面說明的，通過采用柱溫箱，可以得到各種不同的效果。但是需要注意的是，如果將溫箱溫度提得過高，則會縮短柱的壽命，有時候會使柱的分離選擇性變差。
