在萃取樣品之前，吸附劑經過適當的預處理，一足為了潤濕和活化固相萃取填料，以使目標萃取物與固相表面緊密接觸，易于發生分子間相互作用；二是為了除去填料中可能存在的雜質．減少污染。采取的方法是用量溶劑沖洗萃取柱。
反相類型的固相萃取硅膠和非性吸附劑介質，通常用水溶性有機溶劑如甲醇預處理，甲醇潤濕吸附劑表面和滲透鍵臺烷基相，便于水有效地潤濕硅膠表面。然后用水或緩沖溶液替換滯留在柱中的甲醇，以使樣品水溶液與吸附劑表面有良好的接觸，提高萃取效率。正相類型的固相萃取硅膠和性吸附劑介質，通常用樣品所在的有機溶劑來預處理。離子交換填料一般用3—5ml。去離子水或低濃度的離子緩沖溶液來預處理。
固相萃取填料從預處理到樣品加入都應保持濕潤，如果在樣品加入之前，萃取柱中的填料于了，需要重復預處理過程。并且在重新引入有機溶劑之前，先要用水沖洗革取柱內緩沖溶液中的鹽分。
將樣品倒^活化后的SPE小柱，然后利用加壓、抽真空或離心的方法使樣品進入吸附劑。采取手動或泵以正壓推動或負壓抽吸方式，使液體樣品以適當流速通過固相萃取柱，此時，樣品中的日標萃取物被吸附在固相萃取柱填料上。
洗滌的目的是為r除去吸附在固相萃取柱上的少量基體下擾組分。一般選擇中等強度的混合溶劑，盡可能除去基體中的干擾組分，又不會導致目標萃取物流失。如反相萃取體系常選用比例組成的有機溶劑水混合液，有機溶劑比例應大于樣品溶液而小于洗脫劑溶液。
選擇適當的洗脫溶劑洗脫被分析物，收集洗脫液，揮干溶劑以備后用或直接進行在線分析。為了盡可能將分析物洗脫，使比分析物吸附強的雜質留在SPE柱上，需要選擇強度合適的洗脫溶劑。
